Den 30 juni 1964, strax före självständigheten, beviljades det brittiska territoriet Nyasaland, som byttes namn till Malawi vid självständighet, ett vapen, som ersatte ett flaggmärke av tidigare brittiskt kolonialt ursprung. Den nya designen visade en leopard och ett lejon med en sköld mellan sig. På skölden stod en stiliserad flod, ett lejon och en stigande gul sol. Det nationella mottot ”Enhet och frihet” dykt upp under armarna och högst upp låg en gul skiva som omgjordes av en skallig örn.
Frågesport som utforskar Afrika: fakta eller fiktion? Det snöar aldrig i Kenya.Malawis första nationella flagga hissades vid självständighet den 6 juli 1964. Flaggans design, tre lika horisontella ränder av svart, rött och grönt, motsvarade flaggan som användes av Malawi Congress Party, då den dominerande politiska kraften i landet. Ränder på flaggan symboliserade respektive det afrikanska folket i landet, martyrernas blod för självständighet och Malawis ständigt gröna natur. Landets namn betyder "flammande vatten", med hänvisning till solnedgången vid sjön Nyasa (känd i Malawi som Malawisjön), och en röd halvsol lades till den nationella flaggans översta rand för att skilja den från partiflaggan.
Pres. Bingu wa Mutharika föreslog att den nationella flaggan skulle ändras, och den nya designen antogs den 29 juli 2010 och hissades först den 7 augusti. Ränderna i flaggan ordnades om till röd-svartgrön och den stigande halvsolen togs bort . I stället dök upp en helt vit sol, med 45 strålar som strålade ut från den, centrerad i flaggan. Motiveringen för förändringen var att medan halvsolen symboliserade det nya framväxande landet, betecknade hela solen Malawis mognad som nation.
Den nya flaggan gillades dock av ett stort segment av befolkningen i Malawi, som föredrog den ursprungliga 1964-flaggan. Mutharika dog i april 2012, och hans efterträdare, Joyce Banda, lovade att återställa den gamla flaggan. Malawis parlament röstade för att återinföra det som nationell flagga den 28 maj, och det återupptogs.
