Uzbekistan legaliserade designen av sin nya nationella flagga den 18 november 1991. Mer än 200 förslag hade lämnats in i en flaggdesigntävling; det vinnande mönstret hade fem olika horisontella ränder, som i flaggan som antogs 1952 när landet var känt som den uzbekiska sovjetiska socialistiska republiken. Den tidigare flaggans horisontella ränder av röd-blå-röd med vita fimbriationer symboliserade kommunismen och vattnet som tillät bomull och andra jordbruksprodukter. I den nya designen är blå också för vatten men motsvarar också den flagga som förmodligen används av Timur, den stora härskaren från 1300-talet i ett imperium centrerat på Samarkand. Den gröna randen i den nya flaggan föreslår islam men hänvisar officiellt till natur, fertilitet och nytt liv. Den vita randen är för fred och strävan efter moralisk renhet i tanke och gärningar.De röda fimbriationerna hänvisar till den livskraft som är inneboende i alla människor.
I stället för guldhammaren, skäran och stjärnan i flaggan 1952–91 har den nya designen 12 vita stjärnor och en vit halvmåne. Stjärnorna motsvarar årets månader och konstellationerna i zodiaken och påminner därmed om de astronomiska vetenskaper som utvecklats i medeltida Uzbekistan. Halvmånen förbjuder återfödelsen av en oberoende republik, även om många uzbeker och andra sannolikt ser det också som en muslimsk symbol. Den tävlingsvinnande flaggan 1991 utelämnade halvmånen och stjärnorna från flaggans baksida, men de lades sedan till.
