Efter andra världskriget ändrade Sovjetunionens medlemsrepubliker sina flaggor för att få in ränder av nationella färger. Tadzjikistan var den sista av de 15 som agerade. Tidigare sovjetiska tadzjikiska flaggor hade varit röda med den vanliga kommunistiska hammaren, skäran och stjärnemblemet ovanför statens namn i guldbokstäver. Den 20 mars 1953 lade Tadzjikistan till två vågräta ränder, vita över ljusgröna, till den sovjetiska röda bannern med sin guldhammare och skäran och den guldgränsade röda stjärnan. Det gröna representerade vinodling och jordbruksprodukter, medan vitt stod för bomullen som hade gjort Tadzjikistan känd.
Tadzjikistan proklamerade sitt oberoende den 9 september 1991, men återigen var det långsamt att ändra sin flagga. Den nya designen från 24 november 1992 innehåller samma fyra färger som 1953-flaggan. Green sägs nu stå för jordbruksproduktion, medan rött är en "symbol för statlig suveränitet." Vit har samma betydelse som tidigare, med hänvisning till bomullsgrödan. Kronan i mitten av den vita randen är täckt med en båge av sju guldstjärnor: dessa sägs representera enhet bland de olika sociala klasserna i landet, inklusive arbetare, bönder och intellektuella.
